曹序自序序例卷之一·阴阳脏腑部阴阳五脏卷之二·阴阳脏腑部诊法通论诊虚实法、诊寒热法（俱入治法）诊病传变（诊病将死期入诊生死条）诊病愈剧诊生死诸脉诊病杂法诊一岁病证相同卷之三·阴阳脏腑部治法通论倒仓法药
黄帝内经素问遗篇
鲁府禁方
灵枢九针十二原第一法本输第二法地小针解第三法人邪气藏府病形第四法时根结第五法音寿天刚柔第六法律官针第七法星本神第八法民终站第九法野经脉第十经别第十一经水第十二经筋第十三骨度第十四五十营第十五营气第十六
序卷一治喉秘法治喉要诀临症二十法焦氏喉症图形针药秘传单方治喉痹单方卷二应用良方焦氏喉科煎药方诸穴灸刺各法附方
皮肤针疗法皮内针疗法三棱针疗法水针疗法挑刺疗法拔罐疗法火罐的来源火罐的种类拔罐吸拔的方法各种拔罐法的运用拔罐操作方法拔罐注意事项怎样避免火罐烫伤拔罐适应症、主穴、禁忌芒针疗法芒针针具芒针治疗特点芒针针
秘传外科方
序卷一杂症述略卷二妇科述略胎前论治卷三产后述略
序卷上本经上品人参甘草黄白术苍术（附）薯蓣石斛酸枣仁大枣芡实莲实莲花（附）莲蕊须（附）莲房（附）莲薏（附）荷叶（附）荷鼻（附）薏苡仁大麻仁巨胜子赤箭干地黄麦门冬天门冬葳蕤牛膝杜仲枸杞枸杞苗（附）地骨皮
凡例上编上编卷一·补剂温中人参黄当归白术龙眼大枣荔枝饴糖鸡肉牛肉鲫鱼蜜平补葳蕤黄精甘草桑寄生柏子仁冬青合欢陈仓米山药扁豆鸭肉鸽肉阿胶羊肉燕窝蜡补火附子仙茅胡芦巴淫羊藿蛇床子远志肉桂沉香石硫黄阳起石石钟