正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
断死证秘诀秘受不治法受伤治法通用方秘传方附录验方四则
提要看症口诀四季口诀大寒小寒七香跌打丸跌打总方回生丹跌打吊瘀煎水洗方
八十一难经
简介自序凡例卷上卷中卷下
救自缢良方救溺死救冻死救五绝救诸伤伤眼耳中毒箭鸟枪伤汤火伤诸物咬伤救诸毒物性相反误食伤人水毒避蛊毒挑生毒吞鸦片烟毒野芋毒
卷第一治伤寒时气、温疫初起方治疫气伤寒，三日以后不解者方治伤寒中风方治伤寒汗出不解如疟方治伤寒胸闷、腹满方治伤寒后呕恶不食虚羸方治伤寒后烦渴及口干方治伤寒后下利脓血及发斑方治伤寒鼻衄、喉痛、疮方治伤寒
洄溪医案
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
序一序二序三卷上十二经总括诊三部脉法三部九候左右三部六候四季脉名诊五脏四季常脉定四季六脏平脉定四季相克脉诊五脏贼邪脉诊四时虚实脉歌下指轻重法诊五脏动脉法诊六腑平脉法脉息大数诊五脏脉诀男女反脉观人形性脉