正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
序叙卷之一·元集总论辨眼症虚实论辨眼疼有虚实论辨药宜忌论辨热症有虚实气不同论辨五轮病源用药论辨五轮生克论辨心火克肺金白珠生赤丝论辨肺金克肝木黑睛生翳膜论辨眼内生云翳用凉药难退论辨眼珠生翳膜滋肾更甚论辨
序序刻孙真人眼科秘诀序卷之一孙真人眼科总理七十二症秘诀冲和汤玄灵圣方制炉甘石药开明汤十大将军冲翳散揭障丹十二将军二圣散论二圣散扫雾丹制蕤仁之法大决明散赛宝丹调合赛宝丹法补脑还精丸外治烂弦迎风有泪方卷之
一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
养性延命录教诫篇第一食诫篇第二杂诫忌禳害祈善篇第三服气疗病篇第四导引按摩篇第五御女损益篇第六西山群仙会真记序识道识法识人识时识物养生养形养气养心养寿补内补气补精补益补损真水火真龙虎真丹药真铅汞真阴阳炼
养生肤语
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尚论后篇
序宗旨医学色脉脉位脉象经络师传三十二则口问十二则问三焦命门脉问神门脉问冲阳太溪脉问反关脉问人迎气口脉问初诊久按不同说问病同脉异病异治同问从脉不从证从证不从脉问内经脉有阴阳说问高章纲卑损诸脉问辨声色法问
百家针灸歌赋