中风肝气眩晕头风虚劳咳嗽吐血失音肺痿遗精小便不通小便不禁汗脱脾胃木乘土肿胀积聚痞噎膈反胃关格嗳气呕吐吐蛔肠痹便秘肺痹胸痹哮喘呃逆黄胆风寒中寒风温温热冬温伏邪暑湿燥疫疹痰痰饮郁肝火不寐嘈杂三消脾痹疟泄泻
自序序一序二序三序四序五凡例卷一·医学溯源养生稽古阴阳水火生克运气运气总论十二化五运歌十二支年六气歌流年起六气歌客气交日歌逐年主气歌逐年客气歌脏腑（附：腔子、脂膜）脏象应天地脏腑贵贱脏腑命名释义脏腑相
仁斋直指方论
黄帝素问宣明论方
重订产孕集
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
原序一原序二原序三自序医道积习通弊论辨治温热病中宜用白虎汤并不伤人以解世俗之惑，并明概投附、桂、干姜杀人之误卷一·礼集草部甘草生地黄熟地黄麦门冬天门冬葳蕤玄参沙参贝母知母天花粉百部款冬花紫菀郁金桔梗茅
内容提要生理学合参卷一一、西医生理学脑血液皮肤消化器循环器呼吸器排泻器神经系五官器生殖器二、中医生理学五脏六腑此外病理学合参卷二一、热二、痛三、血四、呕吐五、谵语六、泻七、肿，胀八、汗九、头痛十、咳嗽
自序序论脏象论经络次序论经络浅深论奇经八脉论总论宗气论营气论卫气论脉诀论病因论中风论八风论轻重论寒热论证候论风脉论治法论药饵附案
潘序黄序王序马评汤序马评吴序自序凡例重订凡例卷一痈疽总论部位论名烂溃不敛患孔毒根翻花起肛毒瓦斯攻心阴症门阴疽论阴疽治法流注甲疽井泉疽瘰小肠疽鹤膝风横乳岩贴骨疽骨槽风恶核痰核石疽善头鹅掌风鹅爪风冻疮阴疽