序卷上发热恶寒恶风寒热潮热自汗盗汗头汗手足汗无汗头痛项强头眩胸胁满心下满腹满少腹满烦热虚烦烦躁懊舌上苔衄血哕咳卷中喘呕吐悸渴振战栗四逆厥郑声谵语短气摇头螈不仁直视郁冒动气自利筋惕肉热入血室发黄发狂霍乱
医巫闾子医贯序卷之一玄元肤论内经十二官论阴阳论五行论论五行各有五卷之二主客辨疑中风论王安道中风辨口眼 斜厥伤寒论温病论郁病论卷之三绛雪丹书血症论附方卷之四先天要论（上）八味丸方张仲景八味丸用泽泻论水火
医方证治汇编歌诀
医学课儿策
序论痘疹受病之由论痘疹治法类集痘疹已效名方附方附：
铜人针灸经点校说明卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
裘序梁序小引凡例卷一赋禀护胎指纹析义指纹切要三关部位歌浮沉分表里歌红紫辨寒热歌淡滞定虚实歌纹形主病歌小儿脉法《内经》脉要四脉主病主证总括脉要歌脉证宜忌歌保产论难产七因产要附∶气脱案集成三合保胎丸三合保
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
总论第一章 中草药的采集与炮制第一节 中草药的采集与贮藏第二节 中草药的炮制第二章 中草药的性能第一节 四气五味第二节 归经第三节 升降浮沉第三章 中草药的应用第一节 配伍第二节 用量第三节 服用法各
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一