序一序二自序跋凡例太极图（图缺）命门水火图（图缺）五气图（图缺）卷之一医论命门水火图说五气图说论膀胱者州都之官津液藏焉气化则能出矣论补脾补肾治血贵静广嗣方论论诸痿胃气当察辨利痢脉病之殊治病求本驳诸家痨
本草征要
简介序新校正补注内经素问表凡例内篇 卷之一内篇 卷之二内篇 卷之三外篇 卷之四外篇 卷之五外篇 卷之六外篇 卷之七外篇 卷之八外篇 卷之九
自序卷之一·治法通论卷之一·调经门经候总论经闭血崩赤白带下白浊白淫卷之二·杂症门上（杂证男女一也。此二卷方论，出女科书，多杂病书所遗，故存之耳。）虚劳客热寒热恶寒中风飞尸血厥螈颤振惊悸颠狂血风烦闷血风
太医局诸科程文格
孙序卷一三吴治验万历龙飞二年吴小峰小川目疾万历甲戌沈中丞案张孝廉后渠大头疫吴江孙行人痛风（有发明）郑都谏公子痘（有发明）张文学子心病虚弱（有发明）大宗伯董浔阳翁脾胃疾（有发明）董龙山夫人便血马厨疟痢并
原序序卷之一麻疹骨髓赋（增朴）静远主人麻疹西江月（删订）麻证条目法旨用药要诀（删订）增订治麻问答捷要麻疹形式要旨证治秘诀麻疹证治大略括密斋治法大略括验麻色吉凶麻疹轻证麻疹重证麻疹不治证麻疹死证括应用药
第1部分第2部分
小引卷一水部诸水火部诸火土部诸土金部金赤铜铜青自然铜古文钱铅铅粉铅丹密陀僧锡铁落针砂铁精铁锈石部玉云母白石英紫石英丹砂银朱水银轻粉灵砂雄黄雌黄石膏滑石赤石脂炉甘石无名异石钟乳锻石浮石阳起石磁石代赭石禹
高刻丹溪治法心要原序重印丹溪治法心要序卷一中风（第一）癞风（第二）伤寒（第三）内伤（第四）暑（第五）注夏（第六）暑风（第七）胃风（第八）湿（第九）火（第十）郁（第十一）伤风（第十二）时病（第十三）斑疹